Desarrollan un programa bioinformático más barato y accesible para estudiar los genes

Investigadores de la UMU han diseñado un protocolo de laboratorio y los correspondientes programas bioinformáticos que son menos complejos que los anteriormente publicados por profesionales no expertos en bioinformática. A través de este estudio, publicado en la revista 'Frontiers in Plant Science', se ha demostrado que hay diferencias en la metilación de algunos genes en el almendro durante las primeras fases de floración.

La metilación del ADN es un proceso muy importante para los organismos y consiste simplemente en una modificación química de esta molécula. Es una parte de varios mecanismos diferentes que permiten regular la actividad de los genes, además de poder influir en procesos evolutivos. «Cuando iniciamos nuestros trabajos nos encontramos con que los métodos existentes para estudiar la metilación a nivel genómico exigían un gasto bastante elevado para reactivos», señala Rosa María Ros, investigadora principal del grupo de Investigación en Sistemática Molecular, Filogeografía y Conservación en Briófitos de la UMU.

Además, los programas bioinformáticos existentes para analizar los datos llevaban una documentación muy limitada y compleja. Todos estos hechos motivaron al miembro del grupo de investigación Olaf Wener a «buscar una solución más económica» y al desarrollo de programas bioinformáticos más accesibles.

El método desarrollado permite estudiar miles de fragmentos repartidos por el genoma de cientos de muestras diferentes a un coste asumible. Se validó tomando como ejemplo el almendro, en colaboración con el investigador Pedro Martínez-Gómez y la doctora Ángela Sánchez Prudencio, ambos del grupo de Mejora Genética de Frutales del Centro de Edafología y Biología Aplicada del Segura (Cebas). Se demostró que la metilación de algunos genes en estas plantas varía durante la floración.