El presupuesto municipal del Ayuntamiento de San Javier para 2006 asciende a 41 millones de euros, 10 más que el anterior. El incremento se debe al aumento de los valores catastrales, que hace que la previsión de ingresos por el Impuesto de Bienes Inmuebles (IBI) sea de 13.815.000 euros frente a los algo más de 10 millones de euros de 2005.
El capítulo de gastos también se incrementa un 10,14% en lo que se refiere a personal. El gasto corriente crece tres millones de euros por la ampliación de servicios, como una nueva escuela infantil y dos hogares de mayores.
En inversiones, el presupuesto se incrementa un 128%, ya que pasa de 3,8 millones de euros a más de 8 millones. Entre las inversiones previstas destacan dos pabellones deportivos, uno en La Manga y otro en El Mirador, y la terminación de la pista de atletismo en el polideportivo municipal.