Durante estos años de labor directiva y docente, Rafael Bascuñana ha introducido algunas innovaciones en el sistema educativo que lo han acercado más al alumno, como el premio a los alumnos que más se han esforzado durante el curso, no los más brillantes, sino a los que mostraron más voluntad de superar los problemas.

Otra idea que ha apuntado ha sido el acto de graduación a final de curso será a la americana. Un reconocimiento al trabajo de los alumnos y una buena ocasión para reunir a alumnado profesores y familias.

Buena parte de su tarea se ha centrado contra el acoso escolar con comunicaciones a los alumnos de que es algo que no se puede permitir y la disposición a escuchar y solucionar el problema.

Diálogo, pero con un control férreo de la permanencia de los alumnos en el centro, a los que solo se les permite abandonarlo en horas lectivas con la petición expresa de los padres.