En julio de 2004, el equipo de gobierno municipal decidió que la Dama de Elche se ubicara en una sala situada en la primera planta de la Torre del Homenaje, del Palacio de Altamira o Alcázar de la Señoría. Su adecuación y rehabilitación como sede del futuro Museo Arqueológico y de Historia de Elche (MAHE), comenzó a principios de 2001. En la primera fase se llevó a cabo el replanteo del patio de armas y excavaciones, que posibilitó sacar a la luz la puerta antigua del antiguo alcázar islámico, orientada hacia la ladera del río.